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En mamíferos, la transmisión ambiental de microbiota se produce por contacto vaginal durante el parto.
En determinadas circunstancias de reducida motilidad intestinal puede existir sobrecrecimiento microbiano en el intestino delgado, que podría relacionarse con enfermedades intestinales como el síndrome de intestino irritable.
La diversidad bacteriana intestinal podría representar un carácter distintivo a modo de huella microbiana identificativa de cada individuo.
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